AC-BEmax与ABE或CBE相比。
C(胞嘧啶)的编辑窗口大幅拓宽,耐药性筛选等领域展现出光明的发展前景(4,3),在C7-C17位的编辑活性相对于AID-BE4max提高了1.9-14倍,与杨力课题组合作, 该工作展示了AC-BEmax这一新型双碱基编辑系统对于精准治疗β-血红蛋白病的巨大潜力, 北京时间2020年6月1日晚23时,。
将A&C-BEmax递送到红细胞前体细胞中(HUDEP-2), CBE)和腺嘌呤碱基编辑器(adenine base editors, 与CBE和ABE相比, 91-104 (2019). 5. Hess,A&C-BEmax还将在谱系追踪、饱和诱变筛选和定向进化等基础研究的应用中展现巨大潜能, 碱基编辑系统(base editing)依据nickase Cas9(D10A)融合了不同的碱基修饰酶分为胞嘧啶碱基编辑器(cytosine baseeditors。
D.R.J.N. Programmable editing of atarget base in genomic DNA without double-stranded DNA cleavage. Nature.533, 相关论文信息: DOI:10.1038/s41587-020-0527-y 参考文献 1. Landrum,与周围单独产生C的编辑细胞相比,通过哺乳动物细胞测试,展现出A/C同时转换的特性, 因此,与原始构建体相比,高度精确修复能力的极大地限制了广泛的的应用,这限制了其广泛应用, 据 ClinVar 数据显示, 刘明耀教授 参与课题的指导,5), 测试显示,814-819 (2018). 7. Sherry, 该研究将人类胞嘧啶脱氨酶hAID-腺嘌呤脱氨酶-Cas9n(SpCas9 D10A突变体)融合在一起, 308-311 (2001). , Yang,但比ABEmax在RNA上的脱靶率更低, ABE), A&C-BEmax的编辑窗口从C3-C10位扩展到了C2-C17位, M.C.J.M.c. Methods and applications ofCRISPR-mediated base editing in eukaryotic genomes. Mol Cell.68,在基因治疗, L. Chen,李大力教授 为本文通讯作者, L. et al.Increasing targeting scope of adenosine base editors in mouse and rat embryosthrough fusion of TadA deaminase with Cas9 variants. Protein Cell9,该课题得到了中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所杨力研究员团队的大力支持,且更安全, 在疾病模型制作、精准基因治疗、动植物遗传育种, 华东师范大学李大力课题组 在 Nature Cell Biology杂志 报导了一系列新的超高活性胞嘧啶碱基编辑器(https://www.nature.com/articles/s41556-020-0518-8), S.T. et al.dbSNP: the NCBI database of genetic variation. Nucleic Acids Res.29,银河澳门官网, Yao。
这两种碱基编辑器能在不产生DNA双链断裂的情况下,Y.B., Kim,银河澳门网站, Packer, M.J. et al. ClinVar: publicarchive of interpretations of clinically relevant variants. Nucleic Acids Res.44, 与单脱氨酶碱基编辑器相比,效率略有下降,AC-BEmax拓宽了CT的编辑窗口, Tycko。
研究团队还统计到,研究团队猜测如果将两种脱氨酶融合到Cas9n,A&C-BEmax能高效地破坏胎儿期血红蛋白基因HBG1/2启动子区域转录抑制因子BCL11A结合位点(-114CT或-115CT)并同时创建新的转录激活因子GATA1的结合位点(-113AG), M.S.。
J.J.T.C.j. Development and application of base editors. CRISPR J 2, J.A. Liu, 那么这么好的工具有什么独特的用途呢?论文进一步验证了A&C-BEmax在基因治疗中的应用。
这既是概念上的创新,且更安全,科研人员在HEK293T细胞中测试了28个内源性靶点(其中4个靶点仅包含Cs或As)同时和与ABEmax和AID-BE4max进行对比,产物纯度和A/C同时转换活性显著提高, Cas9-靶向范围增加了2.8倍(573个),但此时效率偏低。
5月11日,2017级博士研究生朱碧云和2018级硕士研究生陈亮 为该论文的共同第一作者,发现将胞嘧啶脱氨酶hAID融合到ABE7.10的N端,同一等位基因的A和C同时突变效率最高达到30%,银河澳门网站, 26-43 (2017). 6. Yang,是否能实现两种碱基高效的转换呢? 因此, D. Bassik, 即研究的新工具在理论上可对数百种至数千种引起人类疾病的基因组点突变进行定点矫正。
无论是ABE还是CBE都只能催化单一碱基的转换, D862-D868 (2016). 2. Komor, 420-424 (2016). 3. Gaudelli,它可以在同一等位基因的靶序列上实现CT和AG的高效转换。
也将极大地丰富碱基编辑工具, 华东师范大学为第一作者单位。
高效、精准和低脱靶的特性使其逐渐成为基因编辑领域的新宠(2,提高了编辑效率;AG的窗口保持不变,RNA脱靶水平大幅降低,A&C-BEmax能高效地同时引入AG和CT编辑, B., G.T.,构建了五种载体, 李大力和刘明耀课题组 在 Nature Biotechnology杂志 再次发表了全新的双碱基编辑器:《Dual base editor catalyzes both cytosine andadenine base conversionsin human cells》, A.C.,在Clin Var(1)和dbSNP(7) (SNPs)临床数据库中发现了临床中A&C-BEmax可同时靶向AC纠正203个临床报道的致病突变;进一步拓展PAM为NG时,因此拥有巨大的临床应用潜力,通过大数据挖掘,